Quickstart(最短路径跑通)#

本页使用仓库自带的模型、数据与 examples/recipes/quickstart/ 中的四份配置, 依次运行 feature → train → infer → collect。示例只用于熟悉命令和产物;训练数据只有 1 帧、候选数据只有 5 帧,不能据此判断模型精度或采样效果。正式运行时请换用自己的 模型与数据,并阅读 配置与路径说明。

准备#

先按 安装指南 获取源码并准备含 PyTorch 后端的 DeepMD-kit 环境。 完成后进入仓库根目录,确认 dpeva、dp 都来自当前环境:

dpeva doctor
dp --version

四份配置与训练输入位于 examples/recipes/quickstart/;它们引用仓库内 tests/integration/data/ 的小型夹具。配置中的文件路径相对配置文件所在目录解析, 无需复制夹具、手改 input.json 或建立第二套工作目录。从仓库外执行时,把下方的 examples/recipes/quickstart/*.json 换成对应配置文件的绝对路径即可。

选择运行位置#

Local backend 会在启动命令的当前机器上直接计算,不会自动申请 Slurm 资源。 独占 Linux 服务器可在确认资源可用后执行;共享集群用户应先按站点规则取得 交互式计算资源,再在计算节点运行下面的 Local 示例,或改用 Slurm 提交配置。 不要在登录节点直接执行这组计算命令。通用提交方法见 Slurm 指南,SAI 的环境与队列配置见 SAI 快速上手。

示例虽然只有几帧数据,仍会加载预训练模型并训练 3 个模型;数据帧数不能作为 内存需求的估计。当前没有可供承诺的统一耗时或峰值内存数字,应按实际模型、 硬件和 DeepMD 环境安排资源。先运行 dpeva doctor 检查实际计算环境。

依次运行#

在仓库根目录执行:

dpeva feature examples/recipes/quickstart/feature.json
dpeva train   examples/recipes/quickstart/train.json
dpeva infer   examples/recipes/quickstart/infer.json
dpeva collect examples/recipes/quickstart/collect.json

Local backend 同步执行。先等当前命令成功返回,再运行下一条。训练包括 3 个短步数模型, 仍可能耗时;可用 GPU 加速。需要在 Slurm 上执行时,参阅 SAI 快速上手 和 Slurm 指南。

查看产物#

所有输出位于 examples/recipes/quickstart/work/:

阶段

主要产物

Feature

desc_pool/amourC/C2.npy

Train

0/、1/、2/ 下的模型与训练日志

Infer

0..2/test_val/ 下的 results.*.out 和日志

Collect

dpeva_uq_result/dataframe/ 下的 CSV、dpdata/ 导出目录

成功的工作流会输出 DPEVA_TAG: WORKFLOW_FINISHED;具体日志位置见 产物约定。此小夹具的 collect 阶段可能选出 0 帧,仍会导出候选数据;这是输入规模所致,不是科学效果验证。若失败,先查看 排障指南,尤其检查 dp 是否在 PATH、数据路径以及相邻阶段 的模型数量和任务目录是否一致。重新开始的方法见下节。

接下来可按 配置参考 准备自己的工作目录;标注与分析等其它 工作流的参数和示例见 CLI 指南 与仓库中的 examples/recipes/README.md。

从头重新运行示例#

先确认上一次 Local 进程已退出;如果改成了 Slurm 提交,则先确认关联作业均已结束 或已取消。移动输出目录不会停止计算任务。排查问题时保留日志与运行清单, 不要先删除出错现场。

对于这份小型示例,默认做法是备份整个 work/ 后,从 Feature 开始重跑。 在仓库根目录执行以下命令,只移动本示例的输出,不移动模型、数据或配置:

if [ -d examples/recipes/quickstart/work ]; then
    mkdir -p "$HOME/scratch" &&
    quickstart_backup_dir=$(mktemp -d "$HOME/scratch/dpeva-quickstart.XXXXXX") &&
    mv examples/recipes/quickstart/work "$quickstart_backup_dir/work" &&
    printf 'Previous outputs saved to %s\n' "$quickstart_backup_dir/work"
fi

原来存在 work/ 时,只有看到 Previous outputs saved to ... 且命令无报错, 才继续重跑;备份失败时先处理错误,不要覆盖原输出。原来没有 work/ 则可直接开始。 然后重新执行上文四条工作流命令。该方法保留旧日志、模型与 .dpeva 清单, 新运行使用空工作目录。需要保留已成功阶段、恢复中断运行或重新提交作业时, 先阅读 排障与重跑说明;四个阶段并不共享统一的 断点续跑能力。

换用自己的模型与数据#

熟悉示例后,按以下两种情况准备自己的配置:

  • 沿用本示例模型,只替换数据:修改训练数据与候选数据路径;Feature、Infer、 Collect 应指向同一候选池。核对训练标签、元素映射和训练设置,不要把示例的 30 步训练当作科研生产参数。

  • 更换模型或模型家族:同时选择匹配的 DeepMD 训练模板、模型头与 dp_backend。 本例的 input.json 绑定 DPA3 架构,不能仅替换模型文件路径就视为适用于 DPA4。 DPA4 的现有模板位于 examples/recipes/training/dpa4/,使用前需要准备外部模型、 数据和相应训练统计输入,并调整其提交配置。

具体字段之间的匹配关系见 配置指南。 公开资源包括:

资源

入口

用途

DPA-3.1-3M 预训练模型

AIS Square 模型库

用作微调基座 base_model_path,按模型选择 model_head

FT2DP-dataset-FeCHO-v1

AIS Square 数据集

铁基 FTS 场景的训练集与候选池示例

普通 CLI 工作流通过 JSON 配置指定模型和数据路径。测试夹具文档中的 DPEVA_DPA3_MODEL_PATH、DPEVA_DPA4_MODEL_PATH 属于测试入口约定, 不是所有 CLI 工作流通用的模型路径覆盖开关。字段与路径规则见 配置指南;安装、后端选择与科研环境版本锁定见 安装指南。